Scientific Db Pubmed Database

生物医学文献、MeSH クエリ、PMID 検索、引用取得、および API を利用した文献モニタリングのための PubMed および NCBI E-utilities の直接検索ワークフロー。

293,665 stars 43,456 forksResearch & Science Plugin marketplace

Install

Claude Code plugin
/plugin marketplace add affaan-m/ECC

The repo is a Claude Code plugin marketplace. Run /plugin afterwards to pick the plugin that includes this skill.

skills CLI (Claude Code, Cursor, Codex and more)
npx skills add affaan-m/ECC --skill scientific-db-pubmed-database
Manual install
git clone --depth 1 https://github.com/affaan-m/ECC.git /tmp/ECC
mkdir -p ~/.claude/skills
cp -r /tmp/ECC/docs/ja-JP/skills/scientific-db-pubmed-database ~/.claude/skills/scientific-db-pubmed-database

Personal skills live in ~/.claude/skills. Use .claude/skills in a project folder to share a skill with your team.

From the SKILL.md

# PubMed Database

一般的なウェブ検索ではなく PubMed から生物医学文献が必要なタスクにこのスキルを使用します。

## 使用するタイミング

- MEDLINE または生命科学文献の検索。
- MeSH 用語、フィールドタグ、日付、または文献種別を使った PubMed クエリの構築。
- PMID、アブストラクト、出版メタデータ、または関連引用の検索。
- 再現可能な検索文字列が必要なシステマティックレビューの検索パスの実行。
- Python、シェル、または別の HTTP クライアントから直接 NCBI E-utilities を使用。

## クエリの構築

研究質問から始め、概念に分割し、ブール演算子で概念を組み合わせます。

```text
concept_1 AND concept_2 AND filter
synonym_a OR synonym_b
NOT exclusion_term
```

有用な PubMed フィールドタグ:

- `[ti]`: タイトル
- `[ab]`: アブストラクト
- `[tiab]`: タイトルまたはアブストラクト
- `[au]`: 著者
- `[ta]`: 雑誌タイトル略語
- `[mh]`: MeSH 用語
- `[majr]`: 主要 MeSH トピック
- `[pt]`: 出版種別
- `[dp]`: 出版日
- `[la]`: 言語

例:

```text
diabetes mellitus[mh] AND treatment[tiab] AND systematic review[pt] AND 2023:2026[dp]
(metformin[nm] OR insulin[nm]) AND diabetes mellitus, type 2[mh] AND randomized controlled trial[pt]
smith ja[au] AND cancer[tiab] AND 2026[dp] AND english[la]
```

## MeSH とサブヘッディング

概念が安定した統制語彙用語を持つ場合は MeSH を優先します。トピックが新しいまたは用語が多様な場合は MeSH とタイトル/アブストラクト用語を組み合わせます。

正しいサブヘッディング構文では、サブヘッディングをフィールドタグの前に置きます:

```text
diabetes mellitus, type 2/drug therapy[mh]
cardiovascular diseases/prevention & control[mh]
```

`[majr]` は論文の中心的なトピックである必要がある場合にのみ使用します。精度は向上しますが、関連する研究を見逃す可能性があります。

## フィルター

出版種別:

- `clinical trial[pt]`
- `meta-analysis[pt]`
- `randomized controlled trial[pt]`
- `review[pt]`
- `systematic review[pt]`
- `guideline[pt]`

日付フィルター:

```text
2026[dp]
2020:2026[dp]
2026/03/15[dp]
```

利用可能性フィルター:

```text
free full text[sb]
hasabstract[text]
```
Read the full skill on GitHub

Details

Skill name
scientific-db-pubmed-database
Repository
affaan-m/ECC
Path
docs/ja-JP/skills/scientific-db-pubmed-database/SKILL.md
License
MIT
Repo updated
30 October 2026

FAQ

What does the Scientific Db Pubmed Database skill do?

生物医学文献、MeSH クエリ、PMID 検索、引用取得、および API を利用した文献モニタリングのための PubMed および NCBI E-utilities の直接検索ワークフロー。

How do I install the Scientific Db Pubmed Database skill?

Claude Code plugin: /plugin marketplace add affaan-m/ECC. Skills go in ~/.claude/skills (personal) or .claude/skills (project), and Claude loads them automatically when a task matches the description.

Is Scientific Db Pubmed Database popular?

It lives in affaan-m/ECC, which has 293,665 GitHub stars and 43,456 forks, and is included in 1 curated skill list.

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